Questo lo spronò nella ricerca di altri metodi terapeutici ed egli cominciò a interessarsi a un’altra branca della medicina: l’immunologia. Divenne assistente di batteriologia presso l’Ospedale Universitario e cominciò a sperare di poter trovare in questa specializzazione una risposta al suo problema. Dai risultati ottenuti, egli cominciò ad avere l’impressione di essere sulla strada giusta nella sua ricerca di un metodo terapeutico in grado di curare anche quei difficili casi cronici che resistevano a tutte le terapie. In breve tempo egli scoprì che alcuni batteri intestinali, ai quali fino ad allora si era data poca importanza, erano invece strettamente collegati con le malattie croniche.

Questi batteri erano presenti in quantità decisamente elevata nell’intestino di tutte le persone affette da patologie croniche, ma erano presenti, seppur in quantità decisamente inferiore, anche nell’intestino delle persone sane. I suoi studi si concentrarono quindi su questi batteri, sulle possibili relazioni con i disturbi cronici dei pazienti, sul perché fossero presenti in numero così elevato e se fossero di aiuto o di ostacolo al recupero della salute.

Seguirono mesi e mesi di frenetica ricerca e gradualmente egli si convinse del fatto che il vaccino ottenuto da questi bacilli, una volta iniettato nel sangue dei pazienti, avrebbe avuto l’effetto di ripulire l’organismo dall’intossicazione che aveva causato la malattia cronica. I risultati che ottenne con questa tecnica andarono al di là di qualsiasi aspettativa: lo stato generale dei pazienti migliorava a tal punto che essi riferivano di non essersi mai sentiti meglio e i loro problemi cronici – artrite, reumatismo, emicrania – scomparivano definitivamente.

Nonostante i risultati ottenuti con i vaccini fossero incoraggianti, a Edward Bach non piaceva il fatto di doverli iniettare, causando dolore e gonfiore locale al paziente e si mise quindi alla ricerca di una metodica più semplice.